DNA甲基化分析的完整解決方案
更新時(shí)間：2015-11-29 點(diǎn)擊次數(shù)：2593次Zymo于1994年成立于美國加州Orange County，主要研發(fā)和生物試劑表觀遺傳學(xué)系列產(chǎn)品和常用分子生物學(xué)試劑盒，其DNA甲基化，羥甲基化，核酸提取等產(chǎn)品已得到世界各*實(shí)驗(yàn)室的認(rèn)可，產(chǎn)品具有“快速、簡便、超純”的特點(diǎn)；
Zymo甲基化產(chǎn)品線已被上千次引用在各大主流學(xué)術(shù)刊物上，包括NATURE、SCIENCE 、PNAS、Stem Cells、 NucleicAcids Res等；迄今，EZ DNAMethylation™系列產(chǎn)品作為DNA重亞硫酸鹽處理（DNA甲基化分析前處理）的的金標(biāo)準(zhǔn)，已成為zui和引用次數(shù)zui多的產(chǎn)品；
zui受好評的重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒
產(chǎn)品 1 - EZ DNA Methylation™ Kits(轉(zhuǎn)化率＞99%)
- 該試劑盒已被Illumina, Sequenom, Nimblegen，Agilent，Roche等公司整合入其標(biāo)準(zhǔn)化工作流程中
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| EZ DNA Methylation™ Kit （柱子） | Column, 50 Rxns, 200 Rxns | D5001, D5002 |
| EZ-96 DNA Methylation™ Kit (96孔板高通量） | Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns | D5003, D5004 |
| EZ-96 DNA Methylation MagPrep (高通量磁珠法) | 4x96 rxns, 8x96 rxns | D5040, D5041 |
產(chǎn)品 2 - EZ DNA Methylation™-Gold Kits(轉(zhuǎn)化率＞99%)
- 該試劑盒是目前的重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒，小于3小時(shí)轉(zhuǎn)化時(shí)間
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| EZ DNA Methylation-Gold™ Kit （柱子） | 50 Rxns, 200 Rxns | D5005, D5006 |
| EZ-96 DNA Methylation-Gold™ Kit (96孔板高通量） | Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns | D5007, D5008 |
| EZ-96 DNA Methylation-Gold MagPrep (高通量磁珠法) | 4x96 rxns, 8x96 rxns. | D5042, D5043 |
產(chǎn)品 3 - EZ DNA Methylation™-Direct Kits(轉(zhuǎn)化率＞99.5%)
- 該試劑盒可直接以細(xì)胞（≥10個(gè)細(xì)胞），血液和組織（FFPE）作為起始模板，并適合低樣本起始量（10個(gè)細(xì)胞 或 50pgDNA）
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| EZ DNA Methlyation-Direct™ Kit （柱子） | 50 Rxns, 200 Rxns | D5020, D5021 |
| EZ-96 DNA Methlyation-Direct™ Kit (96孔板高通量） | Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns | D5022, D5023 |
| EZ-96 DNA Methylation-Direct MagPrep (高通量磁珠法) | 4x96 rxns, 8x96 rxns. | D5044, D5045 |
產(chǎn)品 4 - EZ DNA Methylation™-Lightning Kits (轉(zhuǎn)化率＞99.5%)
- 該試劑盒可達(dá)zui快的1小時(shí)處理時(shí)間，*完成DNA的轉(zhuǎn)化
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| EZ DNA Methlyation-Lightning Kit（柱子） | 50 Rxns, 200 Rxns | D5030, D5031 |
| EZ-96 DNA Methylation-Lightning Kit(96孔板高通量） | Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns | D5032, D5033 |
| EZ-96 DNA Methylation-Lightning MagPrep(高通量磁珠法) | 4x96 rxns, 8x96 rxns. | D5046, D5047 |
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圖注：經(jīng)重亞硫酸鹽處理后的DNA測序表明：位點(diǎn)5的甲基胞嘧啶保持不變，而未甲基化的胞嘧啶（如：位點(diǎn)7,9,11,14和15）在重亞硫酸鹽處理后被*轉(zhuǎn)化為尿嘧啶，并在PCR擴(kuò)增后以胸腺嘧啶被檢測到。
產(chǎn)品 5 - EZ RNA Methylation Kit(轉(zhuǎn)化率＞99%)
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| EZ RNA Methylation Kit | 50 prep, 200 prep | R5001, R5002 |
- 該產(chǎn)品為商品化的RNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒
- 配套Zymo Direct-zol™ RNA MiniPrep (Cat.No. R2050， R2052) 使用，效果杠杠的！
- 轉(zhuǎn)化得到的RNA可用于RT-PCR, sequencing, library preparation and Next-Gen sequencing等
DNA 標(biāo)準(zhǔn)品 - 定量 DNA 甲基化程度
Universal Methylated DNA Standards
- 使用甲基化和未甲基化DNA對照，測定重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化效率
- 與Zymo所有重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化產(chǎn)品兼容
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| Human Methylated & Non-Methylated DNA Set | 1 Set | D5014 |
| Human WGA Methylated & Non-Methylated DNA Set | 1 Set | D5013 |
| Universal Methylated Human DNA Standard | 20rxns | D5011 |
| Universal Methylated Mouse DNA Standard | 20rxns | D5012 |
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圖注：使用M.Sssl 甲基化酶測定的*甲基化。
來源于HCT116 DKO細(xì)胞的非甲基化和甲基化的DNA經(jīng)Mspl 和 Hpall 限制性內(nèi)切酶消化處理。Mspl可消化非甲基化和甲基化的DNA，而Hpall只能消化非甲基化DNA，無法消化CpG的甲基化。
5-mC & 5-hmC ELISA Kits - 靈敏的 5-mC 和 5-hmC 定量
- 適用于基因組DNA中5-mC和5-hmC的高通量全局檢測
- 整個(gè)工作流程zui快可在3小時(shí)內(nèi)完成
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| 5-mC DNA ELISA Kit | 1 x 96 Preps 2 x 96 Preps | D5325 D5326 |
| Quest 5-hmC™ DNA ELISA Kit | 1 x 96 Preps 2 x 96 Preps | D5425 D5426 |
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圖注：5-mC DNA ELISA Kit可定量檢測來自于眾多樣本來源DNA中 5-mC程度（%），其結(jié)果與LC-MS檢測樣本結(jié)果密切關(guān)聯(lián)。
其他甲基化研究相關(guān)試劑
| 品名 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
| Anti-5-Methlycytosine Monoclonal Antibody | 15 ul, 30 ul, 50 ul, 200 ul@ 1 ug/ul | A3001-15，A3001-30，A3001-50，A3001-200 |
| Anti-5 hmC Polyclonal Antibody | 25ug/25ul, 50ug/50ul, 200ug/200ul | A4001-25, A4001-50, A4001-200 |
| Methylated – DNA IP Kit | 10 Rxns | D5101 |
| OneStep qMethyl™ Kit | 44 tests | D5310 |
| OneStep qMethyl™ - Lite | 44tests | D5311 |
| Quest 5-hmC Detection Kit (includes Mspl GSRE) | 25 preps, 50 preps | D5410, D5411 |
| Quest 5-hmC Detection-Lite Kit (GSRE not included) | 25 preps, 50 preps | D5415, D5416 |
| Quest 5-hmC DNA Enrichment Kit | 25 rxns. 50 rxns. | D5420, D5421 |
| CpG Methylase (M.Sssl) | 200U, 400U | E2010, E2011 |
| CpG Methylase (M.CviPI) | 200U, 1000U | E2014, E2015 |
| 5-hmC Glucosyltransferase | 100 units, 200 units | E2026, E2027 |
| ZymoTaq DNA Polymerase | 50 rxns. 200rxns | E2001, E2002 |
| ZymoTaq PreMix | 50 rxns. 200rxns | E2003, E2004 |
更多甲基化系列產(chǎn)品請登錄www.zymoresearch。。ｃｏｍ或咨詢吉泰生物
常見問題解答：
Q：在用Zymo的重亞硫酸鹽試劑盒處理前，起始DNA樣本應(yīng)該儲(chǔ)存在TE，水，還是其他緩沖液中？
A：水和TE緩沖液均可用來儲(chǔ)存DNA，并且不會(huì)對轉(zhuǎn)化過程造成干擾。
Q: 為什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit，我的DNA沒有得到*的轉(zhuǎn)化？
A： 1） 如果是固體樣本，很可能是處理的樣本量過大，而導(dǎo)致不*DNA轉(zhuǎn)化；
2）如果是FFPE組織樣本，有可能是DNA已大規(guī)模受損以及/或者交聯(lián)，導(dǎo)致不*轉(zhuǎn)化；
3）如果在Proteinase K消化后，沒有通過離心去除碎片，則可能會(huì)干擾重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化過程，導(dǎo)致DNA的不*轉(zhuǎn)化；
Q: 為什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化（96孔板）產(chǎn)品線有兩種不同的目錄號(hào)？
A: 這兩種不同的目錄號(hào)是用來區(qū)分試劑盒內(nèi)不同類型的96孔板。深孔板和淺孔板均適用于大多數(shù)離心機(jī)和微板架。如下闡釋了這兩類96孔板的區(qū)別：
| Silicon-A | Zymo-Spin I-96 | |
| 款式 | 淺孔 | 深孔 |
| 尺寸（H x W x L） | 19 mm x 83 mm x 125 mm | 35 mm x 83 mm x 125 mm |
| 結(jié)合/收集板組合高度 | 43 mm | 60 mm |
| 結(jié)合力/zui小洗脫體積 | 5µg/30µl per well | 5µg/15µl per well |
| 貨號(hào) | D5003, D5007, D5022, D5032 | D5004,D5008, D5023, D5033 |
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Q： Zymo 重亞硫酸鹽處理試劑盒與illumina技術(shù)平臺(tái)兼容嗎？
A: 是的，Zymo的EZ DNA Methylation Kit技術(shù)被illumina使用在其GoldenGate和Infinium Assays平臺(tái)上；
Q： 用Zymo的EZ DNA Methylation Kit轉(zhuǎn)化得到的DNA可用作哪些下游分析應(yīng)用？
A: 用Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit轉(zhuǎn)化得到的DNA，可適用于后續(xù)的各類測序分析法，Ms-SNuPE, COBRA, Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如： Sequenom的EpiTYPER), 以及其他分析方法。
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